Με την ραγδαία εξέλιξη της μικροσκοπίας, εμφανίζονται συνέχεια νέες ψηφιακές τεχνικές απεικόνισης που εμπλουτίζουν την οπτικοποίηση των διαγνωστικών χαρακτηριστικών. Η υπάρχουσα προηγμένη τεχνολογία, η οποία δίνει έμφαση στη διαγνωστική απόδοση, εμφανίζει συμαντικές ελλείψεις όσον αφορά την αυτοματοποίηση. Έτσι, η εξέταση τεράστιων όγκων δειγμάτων σε μικροσκοπικά επίπεδα μεγέθυνσης αποδεικνύεται ανέφικτη και χρονοβόρα σε πραγματικά περιβάλλοντα. Συνεπώς, η αξιολόγηση βασίζεται σε τυχαία επιλεγμένες αντιπροσωπευτικές περιοχές, οδηγώντας αυτήν την κρίσιμη διαδικασία στην υποκειμενικότητα με τεράστιες αποκλίσεις μεταξύ των παρατηρητών. Η σύγκλιση των τεχνολογιών της μηχατρονικής, των γρήγορων πολυκάναλων αισθητήρων απεικόνισης και των ισχυρών υπολογιστικών συστημάτων, παρέχει καινοτόμες ευκαιρίες για αυτοματοποιημένη πολυτοπική μικροσκοπία επιτυγχάνοντας έτσι βελτιωμένη διαγνωστική απόδοση. Η παρούσα διπλωματική εργασία επικεντρώνεται στην ανάπτυξη ενός ολοκληρωμένου πολυτροπικού μικροσκοπίου υψηλής απόδοσης που όχι μόνο ενισχύει τη χωρική ανάλυση της παρατήρησης αλλά συνδυάζει διάφορες τεχνικές ανάλυσης και απεικόνισης σε ένα ενιαίο εργαλείο. Μέσω της αξιοποίησης των τεχνολογιών μηχατρονικής και των προηγμένων δυνατοτήτων απεικόνισης, το προτεινόμενο μικροσκόπιο επανασχεδιάζει τη μικροσκοπία και την ανάλυση, μειώνοντας σημαντικά τον χρόνο εξέτασης και αυξάνοντας τη διαγνωστική ακρίβεια.