Ιδρυματικό Αποθετήριο [SANDBOX]
Πολυτεχνείο Κρήτης
EN  |  EL

Αναζήτηση

Πλοήγηση

Ο Χώρος μου

Η χημική ομοιότητα των φαρμάκων κατά του καρκίνου και η κατασκευή ενός ολοκληρωμένου δικτύου στόχων φαρμάκων, εστιάζοντας στο μεταβολικό μονοπάτι του καρκίνου

Kallergis Georgios

Απλή Εγγραφή


URIhttp://purl.tuc.gr/dl/dias/3EC71191-BA5E-4824-A8D9-ACD6D9CF37DF-
Αναγνωριστικόhttps://doi.org/10.26233/heallink.tuc.84586-
Γλώσσαen-
Μέγεθος74 pagesen
ΤίτλοςChemical similarity of cancer drugs and the construction of a comprehensive drug target network,focusing on the cancer metabolic pathway.en
ΤίτλοςΗ χημική ομοιότητα των φαρμάκων κατά του καρκίνου και η κατασκευή ενός ολοκληρωμένου δικτύου στόχων φαρμάκων, εστιάζοντας στο μεταβολικό μονοπάτι του καρκίνου el
ΔημιουργόςKallergis Georgiosen
ΔημιουργόςΚαλλεργης Γεωργιοςel
Συντελεστής [Επιβλέπων Καθηγητής]Zervakis Michailen
Συντελεστής [Επιβλέπων Καθηγητής]Ζερβακης Μιχαηλel
Συντελεστής [Μέλος Εξεταστικής Επιτροπής]Stavrakakis Georgiosen
Συντελεστής [Μέλος Εξεταστικής Επιτροπής]Σταυρακακης Γεωργιοςel
Συντελεστής [Μέλος Εξεταστικής Επιτροπής]Sfakianakis Stylianosen
Συντελεστής [Μέλος Εξεταστικής Επιτροπής]Σφακιανακης Στυλιανοςel
ΕκδότηςΠολυτεχνείο Κρήτηςel
ΕκδότηςTechnical University of Creteen
Ακαδημαϊκή ΜονάδαTechnical University of Crete::School of Electrical and Computer Engineeringen
Ακαδημαϊκή ΜονάδαΠολυτεχνείο Κρήτης::Σχολή Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστώνel
ΠερίληψηDrug Repositioning using in silico approaches, gains more and more ground both in academia and in the R& D departments of big pharmaceutical companies mostly because they result in a significant reduction to cost and time assisting in designing more efficient and safer drug molecules. One of the main fields it has been deployed is treating and preventing cancer, which despite the massive efforts on time and investments has not been efficiently tackled yet. This has led to reposition compounds like Acetylsalicylic acid (Aspirin) and Metformin to cure various types of tumour. Chemical similarity is an important concept in drug research. In silico tools for similaritybased approaches are used to identify compounds with similar bioactivities based on structural similarity between two ligands that could share same or similar targets. As chemical similarity seems to be an indication for similar pharmacological activity, this thesis aims to take advantage of it and develop two computational approaches to find approved or experimental drugs which could possibly be used to treat cancer. These are based on algorithms common in chemoinformatics, on machine learning models, and ensemble methods to enhance their performance in order to make confident predictions. The approaches are based on the assessment of the Simplified Molecular-Input Line-Entry System (SMILES) as adequate molecular structure representations for the identification of drug similarities. The first method aims to pairwise drug similarity or similarity among a few compounds, whereas the second one focuses on drug group similarity. Results include suggestions of coxib similar drugs and repositioned drugs focusing on metabolic pathways of cancer.en
ΠερίληψηH επανατοποθέτηση φαρμάκων με χρήση in silico προσεγγίσεων, κερδίζει όλο και περισσότερο έδαφος στην ακαδημαϊκή έρευνα και στα τμήματα Έρευνας και Ανάπτυξης των μεγάλων φαρμακευτικών εταιρειών κυρίως λόγω της επιτυχίας τους στη σημαντική μείωση του κόστους και του χρόνου ανάπτυξης, επικουρώντας στη σχεδίαση πιο αποδοτικών και ασφαλών φαρμάκων. Ένα από τα κύρια πεδία στα οποία έχει χρησιμοποιηθεί είναι η θεραπεία και η πρόληψη του καρκίνου, ο οποίος παρά τις μεγάλες προσπάθειες που γίνονται σε χρόνο κι επενδύσεις δεν έχει αντιμετωπιστεί ακόμα αποτελεσματικά. Αυτό έχει οδηγήσει στον επανατοποθέτηση φαρμάκων όπως το Ακετυλοσακυλικό οξύ (Ασπιρίνη) και η Μετφορμίνη για να θεραπεύσουν διάφορους τύπους καρκίνου. Η χημική ομοιότητα είναι μια σημαντική έννοια στη φαρμακευτική έρευνα. In silico εργαλεία για προσεγγίσεις με βάση την ομοιότητα χρησιμοποιούνται για να αναγνωρίσουν δραστικές με όμοια βιολογική δράση αξιολογώντας τη δομική ομοιότητα μεταξύ ουσιών με όμοιες ή παρόμοιες πρωτεΐνες. Καθώς η χημική ομοιότητα αποτελεί ένδειξη για όμοια φαρμακολογική δράση, αυτή η διπλωματική αποσκοπεί στο να την εκμεταλλευτεί και να αναπτύξει 2 υπολογιστικές προσεγγίσεις για να βρεθούν εγκεκριμένα ή πειραματικά φάρμακα, τα οποία πιθανόν θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν για την αντιμετώπιση του καρκίνου. Αυτές βασίζονται σε συνήθεις μεθόδους στον τομέα της υπολογιστικής χημείας, μοντέλα μηχανικής μάθησης και συνδυασμό αυτών τους ώστε να έχουμε ισχυρές προβλέψεις. Η προσέγγιση γίνεται με αξιολόγηση των SMILES σαν επαρκή μοριακή απεικόνιση για την αναγνώριση φαρμακευτικών ομοιοτήτων. Η πρώτη μέθοδος αφορά την ανά ζεύγη χημική ομοιότητα δύο ενώσεων ή ομοιότητα λίγων δραστικών ενώ η δεύτερη επικεντρώνεται στην ομοιότητα ομάδας φαρμάκων. Τα αποτελέσματα περιλαμβάνουν προτάσεις φαρμάκων όμοιων με τις coxibs και επανατοποθετημένα φάρμακα που εστιάζουν στα μεταβολικά μονοπάτια του καρκίνου.el
ΤύποςΔιπλωματική Εργασίαel
ΤύποςDiploma Worken
Άδεια Χρήσηςhttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/en
Ημερομηνία2020-02-20-
Ημερομηνία Δημοσίευσης2019-
Θεματική ΚατηγορίαMachine learningen
Θεματική ΚατηγορίαComputational pharmaceuticsen
Βιβλιογραφική ΑναφοράGeorgios Kallergis, "Chemical similarity of cancer drugs and the construction of a comprehensive drug target network,focusing on the cancer metabolic pathway.", Diploma Work, School of Electrical and Computer Engineering, Technical University of Crete, Chania, Greece, 2019en
Βιβλιογραφική ΑναφοράΓεώργιος Καλλέργης, "Η χημική ομοιότητα των φαρμάκων κατά του καρκίνου και η κατασκευή ενός ολοκληρωμένου δικτύου στόχων φαρμάκων, εστιάζοντας στο μεταβολικό μονοπάτι του καρκίνου ", Διπλωματική Εργασία, Σχολή Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών, Πολυτεχνείο Κρήτης, Χανιά, Ελλάς, 2019el

Διαθέσιμα αρχεία

Υπηρεσίες

Στατιστικά